MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum EA 2018 EA2018plasmid

Total Repeats: 3817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017296	AATATA	2	12	50	61	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456542
2	NC_017296	TTA	2	6	65	70	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456542
3	NC_017296	GGATA	2	10	86	95	40 %	20 %	40 %	0 %	384456542
4	NC_017296	A	6	6	126	131	100 %	0 %	0 %	0 %	384456542
5	NC_017296	ATT	3	9	136	144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456542
6	NC_017296	AGA	3	9	148	156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456542
7	NC_017296	AGA	2	6	165	170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456542
8	NC_017296	A	6	6	174	179	100 %	0 %	0 %	0 %	384456542
9	NC_017296	TA	3	6	251	256	50 %	50 %	0 %	0 %	384456542
10	NC_017296	ATG	2	6	263	268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456542
11	NC_017296	AAT	2	6	334	339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456542
12	NC_017296	GCTTA	2	10	366	375	20 %	40 %	20 %	20 %	384456542
13	NC_017296	ATC	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456542
14	NC_017296	ATT	2	6	405	410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456542
15	NC_017296	AGG	2	6	465	470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384456542
16	NC_017296	TA	3	6	495	500	50 %	50 %	0 %	0 %	384456542
17	NC_017296	T	6	6	514	519	0 %	100 %	0 %	0 %	384456542
18	NC_017296	CAG	2	6	596	601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456542
19	NC_017296	CA	3	6	676	681	50 %	0 %	0 %	50 %	384456542
20	NC_017296	AATTA	2	10	705	714	60 %	40 %	0 %	0 %	384456542
21	NC_017296	TAGA	2	8	743	750	50 %	25 %	25 %	0 %	384456542
22	NC_017296	GAA	2	6	1361	1366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456543
23	NC_017296	TAT	2	6	1408	1413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456543
24	NC_017296	GTA	2	6	1423	1428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456543
25	NC_017296	TAA	2	6	1445	1450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456543
26	NC_017296	GCA	2	6	1452	1457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456543
27	NC_017296	ATG	2	6	1507	1512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456543
28	NC_017296	ATG	2	6	1645	1650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456543
29	NC_017296	A	7	7	1848	1854	100 %	0 %	0 %	0 %	384456543
30	NC_017296	AGTAT	2	10	1986	1995	40 %	40 %	20 %	0 %	384456543
31	NC_017296	GCA	2	6	2019	2024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456543
32	NC_017296	AGT	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456543
33	NC_017296	A	6	6	2508	2513	100 %	0 %	0 %	0 %	384456543
34	NC_017296	TAGTT	2	10	2576	2585	20 %	60 %	20 %	0 %	384456543
35	NC_017296	CAA	2	6	2587	2592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384456543
36	NC_017296	CTA	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456543
37	NC_017296	CTT	2	6	2632	2637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456543
38	NC_017296	GAT	2	6	2661	2666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456543
39	NC_017296	CTG	2	6	2698	2703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384456543
40	NC_017296	GGA	2	6	2720	2725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384456543
41	NC_017296	ATT	2	6	2751	2756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456543
42	NC_017296	TAG	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456543
43	NC_017296	TAA	2	6	2768	2773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456543
44	NC_017296	ATA	2	6	2820	2825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456543
45	NC_017296	TA	3	6	2871	2876	50 %	50 %	0 %	0 %	384456543
46	NC_017296	AT	3	6	2902	2907	50 %	50 %	0 %	0 %	384456543
47	NC_017296	CATA	2	8	2910	2917	50 %	25 %	0 %	25 %	384456543
48	NC_017296	AGA	2	6	3017	3022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456543
49	NC_017296	TTAGA	2	10	3076	3085	40 %	40 %	20 %	0 %	384456543
50	NC_017296	ATT	2	6	3094	3099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456543
51	NC_017296	TAC	2	6	3110	3115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456543
52	NC_017296	GAT	2	6	3120	3125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456543
53	NC_017296	TA	3	6	3128	3133	50 %	50 %	0 %	0 %	384456543
54	NC_017296	TGA	2	6	3137	3142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456543
55	NC_017296	AAAT	2	8	3143	3150	75 %	25 %	0 %	0 %	384456543
56	NC_017296	TAA	2	6	3212	3217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456543
57	NC_017296	ATA	2	6	3259	3264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456543
58	NC_017296	GAT	2	6	3285	3290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456543
59	NC_017296	ATG	3	9	3376	3384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456543
60	NC_017296	ATT	2	6	3393	3398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456543
61	NC_017296	AT	3	6	3414	3419	50 %	50 %	0 %	0 %	384456543
62	NC_017296	TA	3	6	3420	3425	50 %	50 %	0 %	0 %	384456543
63	NC_017296	AT	3	6	3438	3443	50 %	50 %	0 %	0 %	384456543
64	NC_017296	AAAGT	2	10	3463	3472	60 %	20 %	20 %	0 %	384456543
65	NC_017296	TA	5	10	3501	3510	50 %	50 %	0 %	0 %	384456543
66	NC_017296	TAT	2	6	3522	3527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456543
67	NC_017296	ATA	2	6	3577	3582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456543
68	NC_017296	ATA	2	6	3589	3594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456543
69	NC_017296	ATT	2	6	3622	3627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456543
70	NC_017296	ATG	2	6	3634	3639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456543
71	NC_017296	TAT	2	6	3648	3653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456543
72	NC_017296	AATT	2	8	3683	3690	50 %	50 %	0 %	0 %	384456543
73	NC_017296	TA	4	8	3756	3763	50 %	50 %	0 %	0 %	384456543
74	NC_017296	TAA	2	6	3776	3781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456543
75	NC_017296	ATA	2	6	3808	3813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456543
76	NC_017296	AT	4	8	3852	3859	50 %	50 %	0 %	0 %	384456543
77	NC_017296	TA	4	8	3864	3871	50 %	50 %	0 %	0 %	384456543
78	NC_017296	ATG	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456543
79	NC_017296	GAA	3	9	4109	4117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456544
80	NC_017296	TAT	2	6	4120	4125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456544
81	NC_017296	GGC	2	6	4167	4172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384456544
82	NC_017296	TAAA	2	8	4621	4628	75 %	25 %	0 %	0 %	384456544
83	NC_017296	GACA	2	8	4651	4658	50 %	0 %	25 %	25 %	384456544
84	NC_017296	CTA	2	6	4693	4698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456544
85	NC_017296	TCT	2	6	4719	4724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456544
86	NC_017296	AAT	2	6	4787	4792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456544
87	NC_017296	ACA	2	6	4872	4877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384456544
88	NC_017296	CAG	2	6	4987	4992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456544
89	NC_017296	TACA	2	8	5003	5010	50 %	25 %	0 %	25 %	384456544
90	NC_017296	AAG	2	6	5253	5258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456544
91	NC_017296	TAAA	2	8	5281	5288	75 %	25 %	0 %	0 %	384456544
92	NC_017296	CTA	2	6	5353	5358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456544
93	NC_017296	CTT	2	6	5377	5382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456544
94	NC_017296	TGG	2	6	5435	5440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384456544
95	NC_017296	CAA	2	6	5458	5463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384456544
96	NC_017296	TTG	2	6	5497	5502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456544
97	NC_017296	TA	3	6	5616	5621	50 %	50 %	0 %	0 %	384456544
98	NC_017296	TGA	2	6	5672	5677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456544
99	NC_017296	TA	3	6	5678	5683	50 %	50 %	0 %	0 %	384456544
100	NC_017296	GAT	2	6	5747	5752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456544
101	NC_017296	TAG	2	6	5761	5766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456544
102	NC_017296	ATA	2	6	5781	5786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456544
103	NC_017296	CATG	2	8	5805	5812	25 %	25 %	25 %	25 %	384456544
104	NC_017296	GAT	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456544
105	NC_017296	TAC	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456544
106	NC_017296	GAT	2	6	5865	5870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456544
107	NC_017296	GATAAA	2	12	5958	5969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456544
108	NC_017296	ATG	2	6	6109	6114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456544
109	NC_017296	ATTA	2	8	6129	6136	50 %	50 %	0 %	0 %	384456544
110	NC_017296	TTC	2	6	6167	6172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456544
111	NC_017296	AT	3	6	6174	6179	50 %	50 %	0 %	0 %	384456544
112	NC_017296	TAC	2	6	6261	6266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456544
113	NC_017296	AGTT	2	8	6295	6302	25 %	50 %	25 %	0 %	384456544
114	NC_017296	TAAAAA	2	12	6317	6328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384456544
115	NC_017296	CAG	2	6	6350	6355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456544
116	NC_017296	AAT	2	6	6366	6371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456544
117	NC_017296	TAT	2	6	6381	6386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456544
118	NC_017296	ATG	3	9	6394	6402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456544
119	NC_017296	ATT	2	6	6463	6468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456544
120	NC_017296	ATT	2	6	6487	6492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456544
121	NC_017296	AAT	2	6	6510	6515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456544
122	NC_017296	TGG	2	6	6536	6541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384456544
123	NC_017296	ATA	2	6	6562	6567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456544
124	NC_017296	AT	3	6	6586	6591	50 %	50 %	0 %	0 %	384456544
125	NC_017296	CTA	2	6	6605	6610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456544
126	NC_017296	TAA	2	6	6620	6625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456544
127	NC_017296	TAA	2	6	6661	6666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456544
128	NC_017296	TAC	2	6	7097	7102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456545
129	NC_017296	ATT	2	6	7106	7111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456545
130	NC_017296	GAA	2	6	7232	7237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456545
131	NC_017296	CGA	2	6	7345	7350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456545
132	NC_017296	TTC	2	6	7413	7418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456545
133	NC_017296	CTG	2	6	7459	7464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384456545
134	NC_017296	TGG	3	9	7466	7474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384456545
135	NC_017296	GAA	2	6	7506	7511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456545
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